民國五十二年成立家政學系，即有「家政」與「營養」課程之安排；五十八年奉教育部核准成立「家政系食品營養組」獨立招生；七十三年因實際需要，正式獨立為「食品營養學系」。 95 年為因應保健食品與營養保健觀念之興盛，故更名為「食品暨保健營養學系」。102年度更名為「保健營養學系」，以聚焦教學與研究特色。

食品營養學系歷任系主任為李炳恩、尹德壽、章惠訓、周學中、鄧昭昭、林素一、張國清、楊乃彥、楊開聰及施明智等教授，現任系主任為游宜屏副教授。本系現聘有專任教授1人，專任副教授4人，助理教授1人，專任組員1人，他系支援教授2人，他系支援副教授1人，他系支援助理教授2人，兼任副教授1人，兼任講師3人，其中有博士學位者12人，具碩士學位者5人。